1999年7月11日，学校印发《北京大学关于成立学部学术委员会的通知》（校发[1999]86号），设立信息与工程科学部，杨芙清院士担任首任学部主任，佘振苏、王子宇担任副主任。

2016年4月12日，学校印发《关于北京大学信息与工程科学部班子任职的通知》（校发[2016]58号），聘任高文为北京大学信息与工程科学部主任，张远航、任秋实为北京大学信息与工程科学部副主任。

2019年1月8日，学校印发《关于黄如、高文职务任免的通知》（校发[2019]13号），聘任黄如为北京大学信息与工程科学部主任。

2022年1月11日，学校印发《关于高文、黄如职务任免的通知》（校发[2022]14号），聘任高文为北京大学信息与工程科学部主任，黄如不再兼任北京大学信息与工程科学部主任主任职务。